Как регистрация в США соотносится с регистрацией программы в России или реестром отечественного ПО?

Это разные инструменты для разных задач.

• Российская регистрация программы или базы данных фиксирует права в российской юрисдикции.
• Реестр отечественного ПО даёт статус для льгот и участия в определённых закупках.
• Регистрация в США работает в первую очередь на защиту и подтверждение прав в американской правовой системе.

Для IT‑бизнеса, который смотрит на международный рынок, эти инструменты дополняют друг друга, а не заменяют.